Celloxy.com.tr

NADH NEDIR?

Nikotinamid adenin dinükleotid Hidrojen

Nikotinamid adenin dinükleotid ( NAD ), metabolizmanın merkezi bir kofaktördür . Tüm canlı hücrelerde bulunan NAD, fosfat grupları aracılığıyla birleştirilen iki nükleotidden oluştuğu için dinükleotid olarak adlandırılır . Bir nükleotid, bir adenin nükleobazı ve diğer nikotinamidi içerir . NAD iki biçimde bulunur: sırasıyla NAD + ve NADH ( hidrojen için H ) olarak.

İki hidrojen atomu (bir hidrit iyonu ve bir proton H+) metabolitten çıkartılırlar. Proton çözeltiye salınır. Hidritteki elektron çiftinden biri artı yüklü azota aktarılır, bir hidrojen de azotun karşı tarafında bulunan karbon atomuna bağlanır.

NADH'de depolanan indirgeme potansiyeli, aerobik elektron taşıma zinciri aracılığıyla ATP üretiminde veya anabolik metabolizmada kullanılabilir. ATP hücrelerde yaygın olarak kullanılan bir enerji kaynağıdır ve aerobik şartlarda NADH'nin ATP sentezi için gerekli enerjiye olan katkısı çok önemlidir. . Ancak oksijen eksikliğinde (örneğin hipoksia) NADH'den NAD+'nin yeniden üretimi hücrenin ATP gereksinimini karşılamaya yeterli değildir. Buna karşın glikoliz oksijen gerektirmez ama NAD+'nin yeniden üretimini gerektirir. Oksijen eksikliğinde NADH'nin NAD+'ye yükseltgenmesine fermantasyon denir.

Hücresel solunumun son aşaması oksidatif fosforilasyondur, bu da (1) bir elektron taşıma zinciri ve (2) keiosmozdan oluşur.

Elektron taşıma zinciri ökaryotik hücrelerde mitokondri iç zarında bulunan proteinler ve diğer organik moleküller ve prokaryotik hücrelerin plazma membranıdır. Elektron taşıma zincirinin iki ana işlevi vardır: kemosentez sırasında ATP oluşturmak için kullanılabilecek bir proton gradyan depolama enerjisi üretir ve glikoliz ve sitrik asit döngüsünde kullanılan NAD+ ve FAD gibi elektron taşıyıcıları üretir.

Genellikle elektron taşıma zincirinin molekülleri dört komplekse (I-IV) ayrılır. Moleküller elektronları birden fazla redoks reaksiyonu yla birbirlerine iletirler, elektronları taşıma zinciri boyunca daha yüksekten daha düşük enerji seviyelerine taşırlar. Bu reaksiyonlar, komplekslerin H+ pompalamak için kullandıkları enerjiyi iç zarboyunca (matristen membran lar arası uzaya) salgılarlar. Bu iç zar boyunca bir proton gradyanı oluşturur.

NADH ve FADH2, daha önceki hücresel solunum aşamalarında üretilen azaltılmış elektron taşıyıcılarıdır. NADH elektronları doğrudan karmaşık I'e sokabilir, bu da protonları membranlar arası uzaya pompalamak için açığa çıkan enerjiyi kullanır. FADH2 elektronları intermembran uzaya proton pompamayan tek kompleks olan karmaşık II'ye sokar. Böylece, FADH2 proton degradesine NADH'dan daha az katkıda bulunur. NADH ve FADH2 sırasıyla elektron taşıyıcılarına NAD+ ve FAD dönüştürülür.

Hem NADH hem de FADH2 elektronları karmaşık III'e geçen bir mobil elektron taşıyıcısı olan ubiquinone'ye aktarıyor. Buradan elektronlar mobil elektron taşıyıcı sitokrom c (cyt c)aktarılır. Cyt c elektronları karmaşık IV'e ileterek O2'yegeçer. Oksijen parçalanır ve her biri iki protonu kabul eden iki oksijen atomu oluşturur.

Klinik önemi

NAD + ve NADH'yi yapan ve kullanan enzimler hem farmakolojide hem de hastalık için gelecekteki tedavilere yönelik araştırmada önemlidir . [83] İlaç geliştirme, NAD + 'yı üç şekilde kullanır: ilaçların doğrudan hedefi olarak , NAD'ye bağlı enzimlerin aktivitesini değiştiren yapısına göre enzim inhibitörleri veya aktivatörleri tasarlayarak ve NAD + biyosentezini inhibe etmeye çalışarak . [84]

Kanser hücreleri artan glikoliz kullandığından ve NAD glikolizi arttırdığından, nikotinamid fosforibosiltransferaz (NAD kurtarma yolu) genellikle kanser hücrelerinde güçlendirilir. [85] [86],

Çok sayıda oksidoredüktaz , substratlar olarak NAD + ve NADH kullandığından ve bunları oldukça korunmuş bir yapısal motif kullanarak bağladığından, NAD + bazlı inhibitörlerin bir enzime spesifik olabileceği fikri şaşırtıcıdır. [91] Bununla birlikte, bu mümkün olabilir: örneğin, mikofenolik asit ve tiazofurin bileşiklerine dayanan inhibitörler , NAD + bağlanma bölgesinde IMP dehidrojenazı inhibe eder . Bu enzimin pürin metabolizmasındaki önemi nedeniyle , bu bileşikler anti-kanser, anti-viral veya immünosupresif ilaçlar olarak faydalı olabilir . [91] [92]Diğer ilaçlar enzim inhibitörleri değildir, bunun yerine NAD + metabolizmasında yer alan enzimleri aktive ederler. Sirtuinler , bu tür ilaçlar için özellikle ilginç bir hedeftir çünkü bu NAD'ye bağlı deasetilazların aktivasyonu, bazı hayvan modellerinde ömrü uzatır. [93] Resveratrol gibi bileşikler , bu enzimlerin aktivitesini artırır, bu da hem omurgalılarda [94] hem de omurgasız model organizmalarda yaşlanmayı geciktirme yeteneklerinde önemli olabilir . [95] [96] Bir deneyde, bir hafta boyunca NAD verilen farelerin nükleer-mitokrondriyal iletişimi gelişti. [97]

Bakteriler ve insanlar gibi organizmalar arasındaki NAD + biyosentezinin metabolik yollarındaki farklılıklar nedeniyle , bu metabolizma alanı yeni antibiyotiklerin geliştirilmesi için umut verici bir alandır . [98] [99] , örneğin, enzim nicotinamidase bu enzim, insanlarda mevcut değildir fakat maya ve bakterilerde mevcut olduğu gibi dönüştürür nikotinik asit nikotinamid, ilaç tasarımı için bir hedeftir. [35]

Bakteriyolojide, bazen faktör V olarak adlandırılan NAD, bazı güç üreyen bakteriler için kültür ortamına ek olarak kullanılır . [100]

Koenzim NAD + ilk olarak İngiliz biyokimyacılar Arthur Harden ve William John Young tarafından 1906'da keşfedildi. [101] Kaynatılmış ve filtrelenmiş maya ekstresinin eklenmesinin kaynatılmamış maya ekstraktlarında alkollü fermantasyonu büyük ölçüde hızlandırdığını fark ettiler . Bu etkiden sorumlu olan tanımlanamayan faktörü bir coferment olarak adlandırdılar . Maya özlerinden uzun ve zor bir saflaştırma yoluyla, bu ısıya dayanıklı faktör, Hans von Euler-Chelpin tarafından bir nükleotid şeker fosfat olarak tanımlandı . [102] 1936'da Alman bilim adamıOtto Heinrich Warburg , hidrit transferinde nükleotid koenzimin işlevini gösterdi ve nikotinamid kısmını redoks reaksiyonlarının yeri olarak tanımladı. [103]

NAD + vitamin öncüleri ilk olarak 1938'de Conrad Elvehjem'in karaciğerin nikotinamid şeklinde "anti-siyah dil" aktivitesine sahip olduğunu gösterdiğinde tanımlandı . [104] Sonra, 1939'da, NAD + sentezlemek için niasinin kullanıldığına dair ilk güçlü kanıtı sağladı . [105] 1940'ların başında Arthur Kornberg , biyosentetik yolda bir enzimi ilk tespit eden kişiydi. [106] 1949'da Amerikalı biyokimyacılar Morris Friedkin ve Albert L. Lehninger , NADH'nin sitrik asit döngüsü gibi metabolik yolları oksidatif fosforilasyonda ATP senteziyle ilişkilendirdiğini kanıtladılar .[107] 1958'de Jack Preiss ve Philip Handler, NAD + biyosentezinde yer alan ara ürünleri ve enzimleri keşfetti; [108] [109] Nikotinik asitten kurtarma sentezine Preiss-Handler yolu denir. 2004 yılında, Charles Brenner ve meslektaşları nikotinamid ribozid kinaz yolunu NAD + 'ya çıkardılar. [110]

NAD (P) 'nin redoks olmayan rolleri daha sonra keşfedildi. [1] İlk tespit, 1960'ların başında gözlemlenen ADP-ribozilasyon reaksiyonlarında ADP-riboz donörü olarak NAD + ' nın kullanılmasıydı . [111] 1980'lerde ve 1990'larda yapılan çalışmalar, hücre sinyallemesinde NAD + ve NADP + metabolitlerinin aktivitelerini ortaya çıkardı - örneğin 1987'de keşfedilen siklik ADP-ribozun etkisi. [112]

Metabolizması NAD keşfinden sonra artan ilgi ile, 21. yüzyıla yoğun bir araştırma alanı kalmıştır + denilen bağımlı protein deasetilazlarının Sirtuins tarafından 2000 yılında, Imai ve laboratuarda çalışma arkadaşları Shin-ichiro Leonard P. Guarente . [113] 2009'da Imai, memelilerde yaşlanma ve uzun ömürlülüğün anahtar düzenleyicilerinin sirtuin 1 ve birincil NAD + sentezleme enzimi nikotinamid fosforibosiltransferaz (NAMPT) olduğu şeklindeki "NAD World" hipotezini önerdi . [114] 2016 yılında Imai hipotezini, hücre dışı NAMPT'nin adipoz dokudan geldiğini öne süren "NAD World 2.0" a genişletti.iskelet kası hücrelerinden gelen miyokinler ile birlikte hipotalamusta (kontrol merkezi) NAD + 'ı korur . [115]

Referanslar

^ a b c Pollak N, Dölle C, Ziegler M (2007). "İndirgeme gücü: piridin nükleotidleri - çok sayıda işleve sahip küçük moleküller" . Biochem. J . 402 (2): 205–18. doi : 10.1042 / BJ20061638 . PMC 1798440 . PMID 17295611 .
^ a b c d e f Belenky P, Bogan KL, Brenner C (2007). " Sağlık ve hastalıkta NAD + metabolizması" (PDF) . Trends Biochem. Sci . 32 (1): 12–9. doi : 10.1016 / j.tibs.2006.11.006 . PMID 17161604 . 4 Temmuz 2009'da orjinalinden (PDF)arşivlendi . Alındı 23 Aralık 2007 .
^ Unden G, Bongaerts J (1997). " Escherichia coli'ninalternatif solunum yolları : elektron alıcılarına yanıt olarak enerjetik ve transkripsiyonel düzenleme". Biochim. Biophys. Açta . 1320 (3): 217–34. doi : 10.1016 / S0005-2728 (97) 00034-0 . PMID 9230919 .
^ Windholz, Martha (1983). Merck Endeksi: kimyasallar, ilaçlar ve biyolojik maddelerden oluşan bir ansiklopedi (10. baskı). Rahway NJ, ABD: Merck. s. 909 . ISBN 978-0-911910-27-8.
^ Biellmann JF, Lapinte C, Haid E, Weimann G (1979). "Koenzimden üretilen laktat dehidrojenaz inhibitörünün yapısı". Biyokimya . 18 (7): 1212–7. doi : 10.1021 / bi00574a015 . PMID 218616 .
^ a b Dawson, R. Ben (1985). Biyokimyasal araştırma verileri(3. baskı). Oxford: Clarendon Press. s. 122. ISBN 978-0-19-855358-8.
^ a b Lakowicz JR, Szmacinski H, Nowaczyk K, Johnson ML (1992). "Serbest ve proteine bağlı NADH'nin floresan ömür boyu görüntüleme" . Proc. Natl. Acad. Sci. ABD . 89 (4): 1271–5. Bibcode : 1992PNAS ... 89.1271L . doi : 10.1073 / pnas.89.4.1271 . PMC 48431 . PMID 1741380 .
^ Jameson DM, Thomas V, Zhou DM (1989). "Mitokondriyal malat dehidrojenaza bağlı NADH üzerinde zamana bağlı floresans çalışmaları". Biochim. Biophys. Açta . 994 (2): 187–90. doi : 10.1016 / 0167-4838 (89) 90159-3 . PMID 2910350 .
^ Kasimova MR, Grigiene J, Krab K, Hagedorn PH, Flyvbjerg H, Andersen PE, Møller IM (2006). "Serbest NADH Konsantrasyonu, Farklı Metabolik Koşullar Altında Bitki Mitokondrilerinde Sabit Tutulur" . Plant Cell . 18 (3): 688–98. doi : 10.1105 / tpc.105.039354 . PMC 1383643 . PMID 16461578 .
^ Reiss PD, Zuurendonk PF, Veech RL (1984). "Radyal sıkıştırmalı yüksek performanslı sıvı kromatografisi ile doku pürini, pirimidin ve diğer nükleotidlerin ölçümü". Anal. Biochem . 140 (1): 162–71. doi : 10.1016 / 0003-2697 (84) 90148-9 . PMID 6486402 .
^ Yamada K, Hara N, Shibata T, Osago H, Tsuchiya M (2006). "Nikotinamid adenin dinükleotid ve ilgili bileşiklerin sıvı kromatografisi / elektrosprey iyonizasyon tandem kütle spektrometresi ile eşzamanlı ölçümü". Anal. Biochem . 352(2): 282–5. doi : 10.1016 / j.ab.2006.02.017 . PMID 16574057 .
^ Yang H, Yang T, Baur JA, Perez E, Matsui T, Carmona JJ, Lamming DW, Souza-Pinto NC, Bohr VA, Rosenzweig A, de Cabo R, Sauve AA, Sinclair DA (2007). "Besine Duyarlı Mitokondriyal NAD + Seviyeleri Hücrelerin Hayatta Kalmasını Belirtir" . Hücre . 130 (6): 1095–107. doi : 10.1016 / j.cell.2007.07.035 . PMC 3366687 . PMID 17889652 .
^ Belenky P, Racette FG, Bogan KL, McClure JM, Smith JS, Brenner C (2007). "Nicotinamide riboside, Sir2'nin susturulmasını teşvik eder ve Nrk ve Urh1 / Pnp1 / Meu1 yollarıyla NAD + ' ya kadar ömrünü uzatır ." Hücre . 129 (3): 473–84. doi : 10.1016 / j.cell.2007.03.024 . PMID 17482543 . S2CID 4661723 .
^ Blinova K, Carroll S, Bose S, Smirnov AV, Harvey JJ, Knutson JR, Balaban RS (2005). "Mitokondriyal NADH floresan yaşam sürelerinin dağılımı: matris NADH etkileşimlerinin kararlı durum kinetiği". Biyokimya . 44 (7): 2585–94. doi : 10.1021 / bi0485124 . PMID 15709771 .
^ Hopp A, Grüter P, Hottiger MO (2019). "Glikoz Metabolizmasının NAD + ve ADP-Ribosilasyon ile Düzenlenmesi" . Hücreler . 8 (8): 890. doi : 10.3390 / hücreler8080890 . PMC 6721828 . PMID 31412683 .
^ Todisco S, Agrimi G, Castegna A, Palmieri F (2006). "Saccharomyces cerevisiae'de mitokondriyal NAD +taşıyıcısının tanımlanması " . J. Biol. Chem . 281 (3): 1524–31. doi : 10.1074 / jbc.M510425200 . PMID 16291748 .
^ Srivastava S (2016). "Mitokondriyal ve yaşa bağlı bozukluklarda NAD (+) metabolizması için ortaya çıkan terapötik roller" . Klinik ve Çeviri Tıp . 5 (1): 25. doi : 10.1186 / s40169-016-0104-7 . PMC 4963347 . PMID 27465020 .
^ Zhang N, Sauve AA (2018). "NAD + Metabolik Yolların Sirtuin Aktivitesi Üzerindeki Düzenleyici Etkileri". Moleküler Biyoloji ve Çeviri Biliminde İlerleme . 154 : 71–104. doi : 10.1016 / bs.pmbts.2017.11.012 (6 Kasım 2020 etkin değil). PMID 29413178 .
^ Schafer FQ, Buettner GR (2001). "Hücrenin redoks ortamı, glutatyon disülfür / glutatyon çiftinin redoks durumundan görüldüğü gibi". Ücretsiz Radic Biol Med . 30 (11): 1191–212. doi : 10.1016 / S0891-5849 (01) 00480-4 . PMID 11368918 .
^ Williamson DH, Lund P, Krebs HA (1967). "Sıçan karaciğerinin sitoplazması ve mitokondrisinde serbest nikotinamid-adenin dinükleotidinin redoks durumu" . Biochem. J . 103 (2): 514–27. doi : 10.1042 / bj1030514 . PMC 1270436 . PMID 4291787 .
^ Zhang Q, Piston DW, Goodman RH (2002). "Çekirdek kompresör işlevinin nükleer NADH tarafından düzenlenmesi". Bilim . 295 (5561): 1895–7. doi : 10.1126 / science.1069300. PMID 11847309 . S2CID 31268989 .
^ Lin SJ, Guarente L (Nisan 2003). "Nikotinamid adenin dinükleotid, transkripsiyon, uzun ömür ve hastalığın metabolik bir düzenleyicisi". Curr. Opin. Cell Biol . 15 (2): 241–6. doi : 10.1016 / S0955-0674 (03) 00006-1 . PMID 12648681 .
^ Veech RL, Eggleston LV, Krebs HA (1969). "Sıçan karaciğerinin sitoplazmasındaki serbest nikotinamid-adenin dinükleotid fosfatın redoks durumu" . Biochem. J . 115 (4): 609–19. doi : 10.1042 / bj1150609a . PMC 1185185 . PMID 4391039 .
^ McReynolds MR, Chellappa K, Baur JA (2020). "Yaşa bağlı NAD + düşüşü" . Deneysel Gerontoloji . 134 : 110888. doi : 10.1016 / j.exger.2020.110888 . PMC 7442590 . PMID 32097708 .
^ Katoh A, Uenohara K, Akita M, Hashimoto T (2006). "Arabidopsis'te NAD Biyosentezindeki İlk Adımlar Aspartat ile Başlar ve Plastidde Oluşur" . Plant Physiol . 141 (3): 851–7. doi : 10.1104 / pp.106.081091 . PMC 1489895 . PMID 16698895 .
^ Foster JW, Moat AG (1 Mart 1980). "Nikotinamid adenin dinükleotid biyosentezi ve mikrobiyal sistemlerde piridin nükleotid döngüsü metabolizması" . Microbiol. Rev . 44 (1): 83–105. doi : 10.1128 / MMBR.44.1.83-105.1980 . PMC 373235 . PMID 6997723 .
^ Magni G, Orsomando G, Raffaelli N (2006). "NADP biyosentezinde anahtar bir enzim olan NAD kinazın yapısal ve fonksiyonel özellikleri". Tıbbi Kimyada Mini Yorumlar . 6 (7): 739–46. doi : 10.2174 / 138955706777698688 . PMID 16842123 .
^ Sakuraba H, Kawakami R, Ohshima T (2005). "Hipertermofilik Archaeon Pyrococcus horikoshii'den İlk Archaeal İnorganik Polifosfat / ATP-Bağımlı NAD Kinaz: Klonlama, İfade ve Karakterizasyon" . Appl. Environ. Microbiol . 71 (8): 4352–8. doi : 10.1128 / AEM.71.8.4352-4358.2005 . PMC 1183369 . PMID 16085824 .
^ Raffaelli N, Finaurini L, Mazzola F, Pucci L, Sorci L, Amici A, Magni G (2004). "Mycobacterium tuberculosis NAD kinazın karakterizasyonu: tam uzunluktaki enzimin bölgeye yönelik mutagenez ile fonksiyonel analizi". Biyokimya . 43 (23): 7610–7. doi : 10.1021 / bi049650w . PMID 15182203 .
^ Henderson LM (1983). "Niasin". Annu. Rev. Nutr . 3 : 289–307. doi : 10.1146 / annurev.nu.03.070183.001445 . PMID 6357238 .
^ a b Rajman L, Chwalek K, Sinclair DA (2018). "NAD Artırıcı Moleküllerin Terapötik Potansiyeli: In Vivo Kanıtları" . Hücre Metabolizması . 27 (3): 529–547. doi : 10.1016 / j.cmet.2018.02.011 . PMC 6342515 . PMID 29514064 .
^ Anderson RM, Bitterman KJ, Wood JG, Medvedik O, Cohen H, Lin SS, Manchester JK, Gordon JI, Sinclair DA (2002). "Bir nükleer NAD + kurtarma yolunun manipülasyonu, kararlı durum NAD + seviyelerini değiştirmeden yaşlanmayı geciktirir" . J. Biol. Chem . 277 (21): 18881–90. doi : 10.1074 / jbc.M111773200 . PMID 11884393 .
^ Billington RA, Travelli C, Ercolano E, Galli U, Roman CB, Grolla AA, Canonico PL, Condorelli F, Genazzani AA (2008). "Memeli Hücrelerinde NAD Alımının Karakterizasyonu" . J. Biol. Chem . 283 (10): 6367–74. doi : 10.1074 / jbc.M706204200 . PMID 18180302 .
^ Trammell SA, Schmidt MS, Weidemann BJ, Redpath P, Jaksch F, Dellinger RW, Li Z, Abel ED, Migaud ME, Brenner C (2016). "Nikotinamid ribosid, farelerde ve insanlarda benzersiz ve ağızdan biyolojik olarak kullanılabilir" . Doğa İletişimi . 7 : 12948. Bibcode : 2016NatCo ... 712948T . doi : 10.1038 / ncomms12948 . PMC 5062546 . PMID 27721479 .
^ a b Rongvaux A, Andris F, Van Gool F, Leo O (2003). "Ökaryotik NAD metabolizmasının yeniden yapılandırılması". BioEssays . 25 (7): 683–90. doi : 10.1002 / bies.10297 . PMID 12815723 .
^ Ma B, Pan SJ, Zupancic ML, Cormack BP (2007). " Candida glabrata'da NAD + öncüllerinin asimilasyonu ". Mol. Microbiol . 66 (1): 14–25. doi : 10.1111 / j.1365-2958.2007.05886.x . PMID 17725566 . S2CID 22282128 .
^ Reidl J, Schlör S, Kraiss A, Schmidt-Brauns J, Kemmer G, Soleva E (2000). Haemophilus influenzae'de "NADP ve NAD kullanımı ". Mol. Microbiol . 35 (6): 1573–81. doi : 10.1046 / j.1365-2958.2000.01829.x . PMID 10760156 . S2CID 29776509 .
^ Gerdes SY, Scholle MD, D'Souza M, Bernal A, Baev MV, Farrell M, Kurnasov OV ,ountainerty MD, Mseeh F, Polanuyer BM, Campbell JW, Anantha S, Shatalin KY, Chowdhury SA, Fonstein MY, Osterman AL (2002). "Genetik Ayak İzinden Antimikrobiyal İlaç Hedeflerine: Kofaktör Biyosentetik Yollarından Örnekler" . J. Bacteriol . 184 (16): 4555–72. doi: 10.1128 / JB.184.16.4555-4572.2002 . PMC 135229 . PMID 12142426 .
^ Senkovich O, Speed H, Grigorian A, ve diğerleri. (2005). "Fırsatçı patojen Cryptosporidium parvum'un üç anahtar glikolitik enziminin kristalizasyonu ". Biochim. Biophys. Açta . 1750 (2): 166–72. doi : 10.1016 / j.bbapap.2005.04.009 . PMID 15953771 .
^ a b c Smyth LM, Bobalova J, Mendoza MG, Lew C, Mutafova-Yambolieva VN (2004). "Kan damarlarında ve mesanede postganglionik sinir terminallerinin uyarılması üzerine beta-nikotinamid adenin dinükleotid salınımı" . J Biol Chem . 279 (47): 48893–903. doi : 10.1074 / jbc.M407266200 . PMID 15364945 .
^ a b c Billington RA, Bruzzone S, De Flora A, Genazzani AA, Koch-Nolte F, Ziegler M, Zocchi E (2006). "Hücre dışı piridin nükleotidlerinin ortaya çıkan fonksiyonları" . Mol. Med . 12(11–12): 324–7. doi : 10.2119 / 2006-00075 . Billington . PMC 1829198 . PMID 17380199 .
^ "Enzim İsimlendirme, Uluslararası Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Birliği İsimlendirme Komitesi'nden enzim adları için Öneriler" . 5 Aralık 2007 tarihinde orjinalinden arşivlendi . Erişim tarihi: 6 Aralık 2007 .
^ "ENZYME'nin NiceZyme Görünümü: EC 1.6.5.3" . Expasy . Erişim tarihi: 16 Aralık 2007 .
^ Hanukoğlu I (2015). "Proteopedia: Rossmann kat: Dinükleotid bağlanma sitelerinde bir beta-alfa-beta kat". Biochem Mol Biol Educ . 43 (3): 206–209. doi : 10.1002 / bmb.20849 . PMID 25704928 . S2CID 11857160 .
^ Lesk AM (1995). "Dehidrojenazların NAD bağlayıcı alanları". Curr. Opin. Struct. Biol . 5 (6): 775–83. doi : 10.1016 / 0959-440X (95) 80010-7 . PMID 8749365 .
^ Rao ST, Rossmann MG (1973). "Proteinlerdeki süper ikincil yapıların karşılaştırılması". J Mol Biol . 76 (2): 241–56. doi : 10.1016 / 0022-2836 (73) 90388-4 . PMID 4737475 .
^ Goto M, Muramatsu H, Mihara H, Kurihara T, Esaki N, Omi R, Miyahara I, Hirotsu K (2005). "Delta1-piperidein-2-karboksilat / Delta1-pirolin-2-karboksilat redüktazın kristal yapıları, yeni bir NAD (P) H'ye bağlı oksidoredüktazlar ailesine aittir: konformasyonel değişim, substrat tanıma ve reaksiyonun stereokimyası" . J. Biol. Chem . 280 (49): 40875–84. doi : 10.1074 / jbc.M507399200 . PMID 16192274 .
^ a b Bellamacina CR (1 Eylül 1996). "Nikotinamid dinükleotid bağlanma motifi: nükleotid bağlayıcı proteinlerin bir karşılaştırması". FASEB J . 10 (11): 1257–69. doi : 10.1096 / fasebj.10.11.8836039 . PMID 8836039 .
^ Carugo O, Argos P (1997). "NADP'ye bağımlı enzimler. I: Kofaktör bağlanmasının korunmuş stereokimyası". Proteinler . 28 (1): 10–28. doi : 10.1002 / (SICI) 1097-0134 (199705) 28: 1 <10 :: AID-PROT2> 3.0.CO; 2-N . PMID 9144787 .
^ Vickers TJ, Orsomando G, de la Garza RD, Scott DA, Kang SO, Hanson AD, Beverley SM (2006). "Leishmania metabolizmasında ve virülansta metilenetetrahidrofolat redüktazın biyokimyasal ve genetik analizi" . J. Biol. Chem . 281 (50): 38150–8. doi : 10.1074 / jbc.M608387200 . PMID 17032644 .
^ Schmidt-Rohr K (2020). "Oksijen, Karmaşık Çok Hücreli Yaşamı Güçlendiren Yüksek Enerjili Moleküldür: Geleneksel Biyoenerjetikte Temel Düzeltmeler" . ACS Omega . 5 (5): 2221–2233. doi : 10.1021 / acsomega.9b03352 . PMC 7016920 . PMID 32064383 .
^ Bakker BM, Overkamp KM, Kötter P, Luttik MA, Pronk JT (2001). " Saccharomyces cerevisiae'de NADH metabolizmasının stokiyometrisi ve kompartmanlanması " . FEMS Microbiol. Rev . 25 (1): 15–37. doi : 10.1111 / j.1574-6976.2001.tb00570.x . PMID 11152939 .
^ Zengin PR (2003). "Keilin solunum zincirinin moleküler mekanizması" (PDF) . Biochem. Soc. Trans . 31 (Pt 6): 1095–105. doi : 10.1042 / BST0311095 . PMID 14641005 . S2CID 32361233 .
^ Heineke D, Riens B, Grosse H, Hoferichter P, Peter U, Flügge UI, Heldt HW (1991). "İç Kloroplast Zarf Membranından Redox Transferi" . Plant Physiol . 95 (4): 1131–1137. doi : 10.1104 / s.95.4.1131 . PMC 1077662 . PMID 16668101 .
^ a b Nicholls DG; Ferguson SJ (2002). Bioenergetics 3 (1. baskı). Akademik Basın. ISBN 978-0-12-518121-1.
^ Sistare FD, Haynes RC (15 Ekim 1985). "İzole sıçan hepatositlerinde sitozolik piridin nükleotid redoks potansiyeli ile laktat / piruvattan glukoneogenez arasındaki etkileşim. Hormon etkisinin araştırılması için çıkarımlar" . J. Biol. Chem. 260 (23): 12748–53. PMID 4044607 .
^ Freitag A, Bock E (1990). " Nitrobacter'de enerji tasarrufu" . FEMS Mikrobiyoloji Mektupları . 66 (1–3): 157–62. doi : 10.1111 / j.1574-6968.1990.tb03989.x .
^ Starkenburg SR, Chain PS, Sayavedra-Soto LA, Hauser L, Land ML, Larimer FW, Malfatti SA, Klotz MG, Bottomley PJ, Arp DJ, Hickey WJ (2006). "Chemolithoautotrophic Nitrite-Oxidizing Bakterium Nitrobacter winogradskyi Nb- 255'in Genom Dizisi " . Appl. Environ. Microbiol . 72 (3): 2050–63. doi : 10.1128 / AEM.72.3.2050-2063.2006 . PMC 1393235 . PMID 16517654 .
^ Ziegler M (2000). "Uzun süredir bilinen bir molekülün yeni işlevleri. Hücresel sinyallemede NAD'nin ortaya çıkan rolleri". EUR. J. Biochem . 267 (6): 1550–64. doi : 10.1046 / j.1432-1327.2000.01187.x . PMID 10712584 .
^ a b Diefenbach J, Bürkle A (2005). "Poli (ADP-riboz) metabolizmasına giriş". Hücre. Mol. Life Sci . 62 (7–8): 721–30. doi : 10.1007 / s00018-004-4503-3 . PMID 15868397 .
^ Berger F, Ramírez-Hernández MH, Ziegler M (2004). "Bir asırlık dönemin yeni hayatı: NAD (P) 'nin sinyal fonksiyonları". Trends Biochem. Sci . 29 (3): 111–8. doi : 10.1016 / j.tibs.2004.01.007 . PMID 15003268 .
^ Corda D, Di Girolamo M (2003). "Yeni Embo Üyesinin İncelemesi: Protein mono-ADP-ribosilasyonunun fonksiyonel yönleri" . EMBO J. . 22 (9): 1953–8. doi : 10.1093 / emboj / cdg209 . PMC 156081 . PMID 12727863 .
^ a b Bürkle A (2005). "Poli (ADP-riboz). NAD + ' nın en ayrıntılı metaboliti ". FEBS J . 272 (18): 4576–89. doi : 10.1111 / j.1742-4658.2005.04864.x . PMID 16156780 . S2CID 22975714 .
^ Seman M, Adriouch S, Haag F, Koch-Nolte F (2004). "Ekto-ADP-ribosiltransferazlar (ART'ler): hücre iletişimi ve sinyallemede ortaya çıkan aktörler". Curr. Med. Chem . 11 (7): 857–72. doi : 10.2174 / 0929867043455611 . PMID 15078170 .
^ Chen YG, Kowtoniuk WE, Agarwal I, Shen Y, Liu DR (Aralık 2009). "Hücresel RNA'nın LC / MS analizi, NAD bağlantılı RNA'yı ortaya çıkarır" . Nat Chem Biol . 5 (12): 879–881. doi: 10.1038 / nchembio.235 . PMC 2842606 . PMID 19820715 .
^ Guse AH (2004). "Siklik adenozin difosforibozun (cADPR) biyokimyası, biyolojisi ve farmakolojisi". Curr. Med. Chem . 11(7): 847–55. doi : 10.2174 / 0929867043455602 . PMID 15078169 .
^ Guse AH (2004). "İkinci haberci siklik adenosin difosforiboz (cADPR) tarafından kalsiyum sinyalinin düzenlenmesi". Curr. Mol. Med . 4 (3): 239–48. doi : 10.2174 / 1566524043360771 . PMID 15101682 .
^ Guse AH (2005). "İkinci haberci işlevi ve döngüsel adenozin difosforibozun (cADPR) yapı-aktivite ilişkisi". FEBS J. 272 (18): 4590–7. doi : 10.1111 / j.1742-4658.2005.04863.x . PMID 16156781 . S2CID 21509962 .
^ Kuzey BJ, Verdin E (2004). "Sirtuins: Sir2 ile ilişkili NAD'ye bağlı protein deasetilazlar" . Genome Biol . 5 (5): 224. doi : 10.1186 / gb-2004-5-5-224 . PMC 416462 . PMID 15128440 .
^ Blander G, Guarente L (2004). "Sir2 protein deasetilaz ailesi" (PDF) . Annu. Rev. Biochem . 73 : 417–35. doi : 10.1146 / annurev.biochem.73.011303.073651 . PMID 15189148 . S2CID 27494475 .
^ Trapp J, Jung M (2006). "Yaşlanmada NAD + bağımlı histon deasetilazların (sirtuinler) rolü". Curr İlaç Hedefleri . 7 (11): 1553–60. doi : 10.2174 / 1389450110607011553 . PMID 17100594 .
^ Wilkinson A, Day J, Bowater R (2001). "Bakteriyel DNA ligazları". Mol. Microbiol . 40 (6): 1241–8. doi : 10.1046 / j.1365-2958.2001.02479.x . PMID 11442824 . S2CID 19909818 .
^ Schär P, Herrmann G, Daly G, Lindahl T (1997). "Saccharomyces cerevisiae'nin yeni tanımlanmış DNA ligazı,çift sarmallı DNA kırıklarının RAD52'den bağımsız onarımında rol oynar" . Genler ve Gelişim . 11 (15): 1912–24. doi : 10.1101 / gad.11.15.1912 . PMC 316416 . PMID 9271115 .
^ a b c Li, Haz; Bonkowski, Michael S .; Moniot, Sébastien; Zhang, Dapeng; Hubbard, Basil P .; Ling, Alvin JY; Rajman, Luis A .; Qin, Bo; Lou, Zhenkun; Gorbunova, Vera; Aravind, L .; Steegborn, Clemens; Sinclair, David A. (23 Mart 2017). "Yaşlanma sırasında protein-protein etkileşimlerini düzenleyen korunmuş bir NAD bağlama cebi" . Bilim . 355(6331): 1312-1317. Bibcode : 2017Sci ... 355.1312L . doi : 10.1126 / science.aad8242 . PMC 5456119 . PMID 28336669 .
^ Ziegler M, Niere M (2004). "NAD + tekrar yüzeye çıkıyor". Biochem. J . 382 (Pt 3): e5–6. doi : 10.1042 / BJ20041217. PMC 1133982 . PMID 15352307 .
^ Koch-Nolte F, Fischer S, Haag F, Ziegler M (2011). "NAD + -bağımlı sinyallemenin bölümlenmesi". FEBS Lett . 585 (11): 1651–6. doi : 10.1016 / j.febslet.2011.03.045 . PMID 21443875 . S2CID 4333147 .
^ Breen LT, Smyth LM, Yamboliev IA, Mutafova-Yambolieva VN (2006). "beta-NAD, insan mesane detrusor kasındaki sinir terminallerinin uyarılması üzerine salınan yeni bir nükleotiddir" (PDF) . Am. J. Physiol. Renal Physiol . 290 (2): F486–95. doi : 10.1152 / ajprenal.00314.2005 . PMID 16189287 . S2CID 11400206 .
^ a b Mutafova-Yambolieva VN, Hwang SJ, Hao X, Chen H, Zhu MX, Wood JD, Ward SM, Sanders KM (2007). "Beta-nikotinamid adenin dinükleotid, viseral düz kasta inhibe edici bir nörotransmiterdir" . Proc. Natl. Acad. Sci. ABD . 104(41): 16359–64. Bibcode : 2007PNAS..10416359M . doi : 10.1073 / pnas.0705510104 . PMC 2042211 . PMID 17913880 .
^ a b Hwang SJ, Durnin L, Dwyer L, Rhee PL, Ward SM, Koh SD, Sanders KM, Mutafova-Yambolieva VN (2011). "-nikotinamid adenin dinükleotidi, insan ve insan olmayan primat kolonlarında enterik bir inhibe edici nörotransmiterdir" . Gastroenteroloji . 140 (2): 608–617.e6. doi : 10.1053 / j.gastro.2010.09.039 . PMC 3031738 . PMID 20875415 .
^ Yamboliev IA, Smyth LM, Durnin L, Dai Y, Mutafova-Yambolieva VN (2009). "NGF ile farklılaştırılmış sıçan feokromasitoma PC12 hücrelerinde beta-NAD, ATP ve dopaminin depolanması ve salgılanması" . EUR. J. Neurosci. 30 (5): 756–68. doi : 10.1111 / j.1460-9568.2009.06869.x . PMC 2774892 . PMID 19712094 .
^ Durnin L, Dai Y, Aiba I, Shuttleworth CW, Yamboliev IA, Mutafova-Yambolieva VN (2012). " Sıçan beyninde hücre dışı β-nikotinamid adenin dinükleotidinin (β-NAD + ) salınması, nöronal etkileri ve uzaklaştırılması " . EUR. J. Neurosci . 35(3): 423–35. doi : 10.1111 / j.1460-9568.2011.07957.x . PMC 3270379 . PMID 22276961 .
^ Wang C, Zhou M, Zhang X, Yao J, Zhang Y, Mou Z (2017). "Arabidopsis thaliana'da hücre dışı nikotinamid adenin dinükleotid için potansiyel bir sensör olarak bir lektin reseptör kinaz" . eLife . 6 : e25474. doi : 10.7554 / eLife.25474 . PMC 5560858 . PMID 28722654 .
^ Sauve AA (Mart 2008). "NAD + ve B3 vitamini: metabolizmadan tedavilere". The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics . 324 (3): 883–93. doi : 10.1124 / jpet.107.120758 . PMID 18165311 . S2CID 875753 .
^ Khan JA, Forouhar F, Tao X, Tong L (2007). "İlaç keşfi için çekici bir hedef olarak nikotinamid adenin dinükleotid metabolizması". Uzman Opin. Ther. Hedefler . 11 (5): 695–705. doi : 10.1517 / 14728222.11.5.695 . PMID 17465726 . S2CID 6490887 .
^ Yaku K, Okabe K, Hikosaka K, Nakagawa T (2018). "Kanser Terapötiklerinde NAD Metabolizması" . Mikrobiyolojide Sınırlar . 8 : 622. doi : 10.3389 / fonc.2018.00622 . PMC 6315198 . PMID 30631755 .
^ Pramono AA, Oldukça GM, Herman H (2020). "Kanserde Terapötik Hedefler Olarak NAD- ve NADPH Katkıda Bulunan Enzimler: Genel Bir Bakış" . Biyomoleküller . 10 (3): 358. doi: 10.3390 / biom10030358 . PMC 7175141 . PMID 32111066 .
^ Swerdlow RH (1998). "NADH, Parkinson hastalığının tedavisinde etkili midir?". Yaşlanma İlaçları . 13 (4): 263–8. doi : 10.2165 / 00002512-199813040-00002 . PMID 9805207 . S2CID 10683162 .
^ Timmins GS, Deretic V (2006). "İzoniazidin etki mekanizmaları". Mol. Microbiol . 62 (5): 1220–7. doi : 10.1111 / j.1365-2958.2006.05467.x . PMID 17074073 . S2CID 43379861 .
^ Rawat R, Whitty A, Tonge PJ (2003). "İzoniazid-NAD eklentisi, Mycobacterium tuberculosis enoyl redüktaz olan InhA'nın yavaş, sıkı bağlanan bir inhibitörüdür: Adduct affinitesi ve ilaç direnci" . Proc. Natl. Acad. Sci. ABD . 100(24): 13881–6. Bibcode : 2003PNAS..10013881R . doi : 10.1073 / pnas.2235848100 . PMC 283515 . PMID 14623976 .
^ Argyrou A, Vetting MW, Aladegbami B, Blanchard JS (2006). "Mycobacterium tuberculosis dihidrofolat redüktaz, izoniazid için bir hedeftir". Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (5): 408–13. doi : 10.1038 / nsmb1089 . PMID 16648861 . S2CID 7721666 .
^ a b Pankiewicz KW, Patterson SE, Black PL, Jayaram HN, Risal D, Goldstein BM, Stuyver LJ, Schinazi RF (2004). "Kofaktör, NAD'ye bağlı inozin monofosfat dehidrojenazın (IMPDH) seçici inhibitörleri olarak taklit eder - ana terapötik hedef". Curr. Med. Chem . 11 (7): 887–900. doi : 10.2174 / 0929867043455648 . PMID 15083807 .
^ Franchetti P, Grifantini M (1999). "Antitümör ve antiviral ajanlar olarak nükleosit ve nükleozid olmayan IMP dehidrojenaz inhibitörleri". Curr. Med. Chem . 6 (7): 599–614. PMID 10390603 .
^ Kim EJ, Um SJ (2008). "SIRT1: yaşlanma ve kanserdeki roller" . BMB Rep . 41 (11): 751–6. doi : 10.5483 / BMBRep.2008.41.11.751 . PMID 19017485 .
^ Valenzano DR, Terzibasi E, Genade T, Cattaneo A, Domenici L, Cellerino A (2006). "Resveratrol, kısa ömürlü bir omurgalıda yaşam süresini uzatır ve yaşa bağlı belirteçlerin başlamasını geciktirir". Curr. Biol . 16 (3): 296–300. doi : 10.1016 / j.cub.2005.12.038 . PMID 16461283 . S2CID 1662390 .
^ Howitz KT, Bitterman KJ, Cohen HY, Lamming DW, Lavu S, Wood JG, Zipkin RE, Chung P, Kisielewski A, Zhang LL, Scherer B, Sinclair DA (2003). "Sirtuinlerin küçük moleküllü aktivatörleri Saccharomyces cerevisiae'nin ömrünü uzatır". Doğa . 425 (6954): 191–6. Bibcode : 2003Natur.425..191H. doi : 10.1038 / nature01960 . PMID 12939617 . S2CID 4395572 .
^ Ahşap JG, Rogina B, Lavu S, Howitz K, Helfand SL, Tatar M, Sinclair D (2004). "Sirtuin aktivatörleri, kalori kısıtlamasını taklit eder ve metazoanlarda yaşlanmayı geciktirir". Doğa . 430 (7000): 686–9. Bibcode : 2004Natur.430..686W . doi : 10.1038 / nature02789 . PMID 15254550 . S2CID 52851999 .
^ Gomes AP, Price NL, Ling AJ, Moslehi JJ, Montgomery MK, Rajman L, White JP, Teodoro JS, Wrann CD, Hubbard BP, Mercken EM, Palmeira CM, de Cabo R, Rolo AP, Turner N, Bell EL, Sinclair DA (19 Aralık 2013). "Azalan NAD +, Yaşlanma Sırasında Nükleer-Mitokondriyal İletişimi Bozan Pseudohipoksik Bir Duruma Neden Olur" . Hücre . 155 (7): 1624–1638. doi : 10.1016 / j.cell.2013.11.037 . PMC 4076149 . PMID 24360282 .
^ Rizzi M, Schindelin H (2002). "NAD ve molibden kofaktör biyosentezinde yer alan enzimlerin yapısal biyolojisi". Curr. Opin. Struct. Biol . 12 (6): 709–20. doi : 10.1016 / S0959-440X (02) 00385-8 . PMID 12504674 .
^ Begley TP, Kinsland C, Mehl RA, Osterman A, Dorrestein P (2001). "Nikotinamid adenin dinükleotidlerinin bakterilerde biyosentezi". Kofaktör Biyosentezi . Vitam. Horm . Vitaminler ve Hormonlar. 61 . s. 103–19. doi : 10.1016 / S0083-6729 (01) 61003-3 . ISBN 978-0-12-709861-6. PMID 11153263 .
^ Menenjit | Laboratuvar Kılavuzu | Hib Kimliği ve Karakterizasyonu | CDC
^ Sertleşme, A; Young, WJ (24 Ekim 1906). "Maya suyunun alkollü fermenti Bölüm II. - Maya suyunun közlenmesi" . Londra Kraliyet Cemiyeti Bildirileri . B Serisi, Biyolojik Karakterli Kağıtlar İçerir. 78 (526): 369–375. doi : 10.1098 / rspb.1906.0070 . JSTOR 80144 .
^ "Şekerlerin ve fermentatif enzimlerin fermantasyonu"(PDF) . Nobel Konferansı, 23 Mayıs 1930 . Nobel Vakfı. 27 Eylül 2007 tarihinde orjinalinden (PDF) arşivlendi . Alındı 30 Eylül 2007 .
^ Warburg O, Christian W (1936). "Pyridin, der wasserstoffübertragende bestandteil von gärungsfermenten (piridin-nükleotid)" [Piridin, fermantasyon enzimlerinin hidrojen aktaran bileşeni (piridin nükleotid)]. Biochemische Zeitschrift (Almanca). 287 : 291. doi : 10.1002 / hlca.193601901199 .
^ Elvehjem CA, Madden RJ, Strong FM, Woolley DW (1938). "Siyah karşıtı dil faktörünün izolasyonu ve tanımlanması"(PDF) . J. Biol. Chem . 123 (1): 137–49.
^ Axelrod AE, Madden RJ, Elvehjem CA (1939). "Nikotinik asit eksikliğinin hayvan dokularının koenzim I içeriği üzerindeki etkisi" (PDF) . J. Biol. Chem . 131 (1): 85–93.
^ Kornberg A (1948). "İnorganik pirofosfatın, difosfopiridin nükleotidin tersinir enzimatik sentezine katılımı" (PDF) . J. Biol. Chem . 176 (3): 1475–76. PMID 18098602 .
^ Friedkin M, Lehninger AL (1 Nisan 1949). "Dihidrodifosfopiridin nükleotid ve oksijen arasındaki elektron taşınmasına bağlı inorganik fosfatın esterleştirilmesi" . J. Biol. Chem . 178 (2): 611–23. PMID 18116985 .
^ Preiss J, İşleyici P (1958). "Difosfopiridin nükleotidinin biyosentezi. I. Ara ürünlerin tanımlanması" . J. Biol. Chem . 233 (2): 488–92. PMID 13563526 .
^ Preiss J, İşleyici P (1958). "Difosfopiridin nükleotidinin biyosentezi. II. Enzimatik yönler". J. Biol. Chem . 233 (2): 493–500. PMID 13563527 .
^ Bieganowski, P; Brenner, C (2004). "Bir Besin Maddesi ve Korunmuş NRK Genleri Olarak Nikotinamid Ribositin Keşifleri, Mantarlarda ve İnsanlarda NAD + 'ya Ön-İşleyicilerden Bağımsız Bir Yol Kurar". Hücre . 117 (4): 495–502. doi : 10.1016 / S0092-8674 (04) 00416-7 . PMID 15137942 . S2CID 4642295 .
^ Chambon P, Weill JD, Mandel P (1963). "Yeni DNA bağımlı poliadenilik asit sentezleyen nükleer enzimin nikotinamid mononükleotid aktivasyonu". Biochem. Biophys. Res. Commun . 11 : 39–43. doi : 10.1016 / 0006-291X (63) 90024-X . PMID 14019961 .
^ Clapper DL, Walseth TF, Dargie PJ, Lee HC (15 Temmuz 1987). "Piridin nükleotid metabolitleri, inositol trisfosfata duyarsızlaştırılmış deniz kestanesi yumurta mikrozomlarından kalsiyum salınımını uyarır" . J. Biol. Chem . 262 (20): 9561–8. PMID 3496336 .
^ Imai S, Armstrong CM, Kaeberlein M, Guarente L (2000). "Transkripsiyonel susturma ve uzun ömür proteini Sir2, NAD'ye bağlı bir histon deasetilazdır". Doğa . 403 (6771): 795–800. Bibcode : 2000Natur.403..795I . doi : 10.1038 / 35001622 . PMID 10693811 . S2CID 2967911 .
^ Imai S (2009). "NAD Dünyası: metabolizma ve yaşlanma için yeni bir sistemik düzenleyici ağ - Sirt1, sistemik NAD biyosentezi ve önemi" . Hücre Biyokimyası ve Biyofizik . 53(2): 65–74. doi : 10.1007 / s12013-008-9041-4 . PMC 2734380 . PMID 19130305 .
^ Imai S (2016). "NAD World 2.0: memelilerin yaşlanmasında ve uzun ömür kontrolünde NAMPT / NAD + / SIRT1'in aracılık ettiği dokular arası iletişimin önemi" . npj Sistem Biyolojisi ve Uygulamaları . 2 : 16018. doi : 10.1038 / npjsba.2016.18 . PMC 5516857 . PMID 28725474 .